Okul Kütüphanemiz; 2012 yılında Pendik İHL Mezunları ve Mensupları Yardımlaşma ve Dayanışma Derneği 1988-1989 Dönemi Mezunlarının katkılarıyla yaptırılmıştır. Okulumuzun 3. katında bulunan kütüphanemizde 2.000 civarında kitap-dergi  bulunmaktadır. Dini eserlerin yanında birçok türden eserin bulunduğu kütüphanemizde daha çok güncel yayına ihtiyaç duyulmaktadır. Aynı anda 25 kişinin faydalanabildiği kütüphanemizden günlük ortalama 80-100 arası öğrenci istifade etmektedir. 70 metrekare alana sahip olan kütüphanemiz  konferans salonumuz olmadığı için toplantı ve organizasyonlara da ev sahipliği yapmaktadır.